پژوهشگران دانشگاه شهید چمران اهواز اقدام به طراحی هدفمند پپتید مهارکننده آنزیم پروتئاز کرونا کردند

به گزارش خبرنگار دانشگاه خبرگزاری دانشجو، محققان دانشگاه شهید چمران اهواز از زمان شیوع کرونا تا به الان در بخش‌های مختلف به مقابله با این ویروس پرداختند و در ادامه این فعالیت‌ها اقدام به طراحی هدفمند پپتید مهارکننده آنزیم پروتئاز کرونا کردند.

سیدعلی همتی، عضو گروه گیاه‌پزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز در این باره گفت: کروناویروس‌ها، ویروس‌های آلوده‌کننده سیستم تنفسی انسان و حیوانات است و بیماری‌هایی از قبیل سرماخوردگی معمولی تا بیماری‌های تنفسی حاد را ایجاد می‌کند.

همتی افزود: تاکنون هفت گونه کروناویروس عفونت‌زا در انسان ردیابی شده که آخرین مورد آن کروناویروس عامل COVID-19 است که در اثر گسترش این ویروس در بیش از ۲۰۰ کشور جهان چندین میلیون نفر به این بیماری مبتلا شده‌اند.

عضو گروه گیاه‌پزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز با اشاره به اینکه تا امروز هیچ گزینه درمانی مؤثری برای این بیماری ارائه نشده است، گفت: یکی از رویکرد‌های مؤثر در روند کشف سریع ترکیبات مطلوب برای درمان این بیماری، بررسی اثر مهارکننده‌های پروتئازی مختلف با منشأ طبیعی بر روی فعالیت آنزیم پروتئاز است.

وی ادامه داد: بر این اساس با استفاده از مطالعات محاسباتی اثرات و توان مهارکننده‌‏های حشرات و گیاهان برای مهار آنزیم پروتئاز اصلی ویروس کرونا در این دانشگاه بررسی شد و در گام نخست کار غربالگری میان مهارکننده‌‏های متعدد با استفاده از سرور‌ها و نرم‌‏افزار‌های تخصصی آغاز شد تا با دستیابی به گزینه مناسب، طراحی پپتید مهارکننده با کارآیی مطلوب صورت پذیرد.

همتی افزود: پس از غربالگری توانستیم با توجه به پنج گزینه‌ی مطلوب شامل مهارکننده‏‌های پروتئازی برگرفته از حشرات ملخ مهاجر، کرم غوزه‌ی پنبه و شب‌پره هندی و همچنین گیاهان سیب‌زمینی شیرین با استفاده از وب‌‏سایت‏‌های مربوطه و بر اساس اختلاف سطوح در دسترس اسیدآمینه‌‏های جایگاه عملکردی آنزیم پروتئاز اصلی کروناویروس در میان‌‌کنش با مهارکننده‌‏های مذکور، پپتید‌های مهارکننده طراحی کنیم.

وی بیان کرد: در گام بعد، توانمندی پپتید‌های طراحی‌شده به عنوان مهارکننده‏های مختلف در میان‌‏کنش با جایگاه عملکردی آنزیم پروتئاز اصلی بیمارگر با استفاده از شبیه‌‏سازی داکینگ مولکولی بررسی شد. بر اساس این نتایج، روشن شد که پپتید مهارکننده حاصل از سیب‌زمینی شیرین و کرم غوزه‏ پنبه دارای مطلوب‌ترین ویژگی‌‏ها شامل بهترین امتیاز داکینگ، کمترین مقدار Z-score، کمترین میزان تغییرات RMSD و منفی‌‏ترین انرژی پیوند کل در میان‌‏کنش با جایگاه عملکردی آنزیم پروتئاز اصلی عامل COVID-۱۹ هستند و در نتیجه قادر به توقف فرآیند بیماری‌زایی ویروس خواهند بود که می‌توانند به‌عنوان گزینه‌‏های مناسب برای سنتز و بررسی‏‌های آزمایشگاهی و بالینی بیشتر، معرفی شوند.